2022年——乃是忍者活跃期间的年代。 所谓的忍术,对于该年代的人们来说,那已经是个日常,但也是个充满了新的运动竞赛方式。 平常只是作为月薪制的工薪族生活,总是展现出被妹妹称为 “废物的是只擅长忍术吧” 的让人吃惊程度地狼狈不堪的样子的青年:神藏莲太郎,他的另一个身份是与暗之忍者军团·虹蛇相战斗的传说的忍者·假面骑士Shinobi。 这是一个暗中保护他人,斩除堕落者的年轻忍者故事。座右铭为——“忍字意为斩刃之心!”
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